《鬼娃回魂3》故事紧接着前作展开。此时，鬼娃恰吉附身的玩偶来到了军事学校。一群军校学生成为了恰吉的新目标。学生亚历克斯在学校里努力适应着严格的训练和生活，然而恰吉的到来打破了校园的平静。恰吉不断制造恐怖事件，先是在宿舍里搞出各种诡异现象，吓得学生们惶恐不安。随着情节发展，恰吉开始对学生们展开致命攻击，他利用自己小巧的身体和邪恶的智慧，在校园的各个角落设下陷阱。亚历克斯逐渐意识到恰吉的危险，他联合几位同学一起对抗恰吉。在激烈的对抗中，他们经历了一次次生死考验，最终凭借智慧和勇气，在学校的操场与恰吉展开了最后的对决，成功将恰吉制服。