《女教皇》以中世纪为背景，讲述了少女琼安的传奇一生。琼安天资聪慧，热爱学习，却因身为女性而被剥夺接受教育的权利。她女扮男装求学，凭借着过人的学识和智慧在教会中崭露头角，一路晋升，最终成为了教皇。然而，她的女性身份始终是一个巨大的隐患。在她任职教皇期间，面临着教会内部的权力斗争和外部的政治压力。一次意外中，她怀孕产子的秘密被揭露，引发了轩然大波。她的命运急转直下，最终在众人的唾弃和指责中悲惨死去。这部影片通过琼安的故事，展现了中世纪女性在男权社会中的挣扎与反抗，以及教会内部的黑暗与腐败。