《异形3》的故事紧接前作，蕾普莉乘坐的飞船在返回地球途中收到求救信号，前往调查时飞船被异形入侵，同伴全部遇难，她带着异形胚胎的克隆体逃生舱降落在一座名为 Fiorina 161 的监狱星球。这里是重刑犯的流放地，蕾普莉的到来打破了监狱的平静。不久后，异形破体而出开始肆虐，它在监狱复杂的环境中神出鬼没，不断猎杀囚犯和狱警。蕾普莉凭借着之前与异形战斗的经验，带领众人对抗异形。但异形太过强大，囚犯们接连死去。最终，蕾普莉意识到只有牺牲自己才能彻底消灭异形，她毅然决然地与异形同归于尽，结束了这场可怕的灾难。