《学园孤岛 真人版》以丧尸肆虐的末日为背景，故事围绕着由直树、惠、胡桃和美纪组成的学园生活部展开。她们看似每日过着轻松的学园生活，在学校里学习、玩耍、料理三餐。然而，这所学校实则已被丧尸包围，外面是一片恐怖的丧尸世界，她们的日常轻松只是一种自我麻痹。直树在这个过程中逐渐意识到现实的残酷，她努力保护着同伴。惠则有着坚强的一面，在危机时刻总是能冷静应对。胡桃天真可爱，美纪温柔细心。她们在丧尸威胁下，为了生存不断寻找物资、加固学校防线，在一次次与丧尸的惊险遭遇中，展现出了友情的力量和对生存的渴望。