《O记三合会档案》以香港警察O记打击三合会犯罪为背景展开。主角陈查礼是O记的一名干练探员，他一心想要将三合会势力一网打尽。三合会在香港横行多年，犯下诸多罪行，包括走私、贩毒、抢劫等。陈查礼和他的团队不断收集三合会的犯罪证据，与三合会成员斗智斗勇。在一次调查毒品走私案件中，他们发现三合会背后有更大的势力在撑腰，这让案件变得更加复杂。随着调查深入，陈查礼等人面临着来自三合会的威胁和报复，但他们毫不退缩。最终，经过艰苦努力，他们成功捣毁了三合会的多个犯罪窝点，将主要头目绳之以法，维护了香港的社会秩序。