在《猫和老鼠：间谍使命》中，经典的猫鼠组合汤姆和杰瑞化身超级间谍，卷入一场惊心动魄的冒险。故事里，邪恶博士发明了能控制人类心智的装置，妄图统治世界。汤姆和杰瑞受秘密组织委托，前去阻止邪恶博士的阴谋。一路上，他们遭遇重重困难。在窃取装置蓝图时，汤姆不小心触发警报，杰瑞机智地引开守卫，两人配合默契，成功拿到蓝图。在追踪博士的过程中，他们还与博士的手下展开激烈追逐，在高楼大厦间上演惊险跳跃。最终，汤姆和杰瑞凭借智慧和勇气，破坏了心智控制装置，拯救了世界，也延续了他们之间既争斗又合作的有趣故事。